Proyecto RELECOV 2.0

Consolidación de las actividades de WGS y RT-PCR para SARS-CoV-2 en España hacia un uso sostenible y la integración de la infraestructura y procesos mejorados en la red RELECOV

La estrategia nacional para la integración de la secuenciación genómica en la vigilancia del SARS-CoV-2 tenía como objetivo incorporar datos de secuenciación genómica para la identificación de las variantes del SARS-CoV-2 circulantes en España. Se creó una Red Nacional de Laboratorios para la Secuenciación Genómica del SARS-CoV-2 (RELECOV) como red de colaboración entre laboratorios de microbiología designados en todas las comunidades autónomas. RELECOV está coordinada por el Laboratorio de Referencia para Virus Respiratorios del Centro Nacional de Microbiología (Instituto de Salud Carlos III). En septiembre de 2021, RELECOV recibió financiación por un año del Centro Europeo para la Prevención y el Control de las Enfermedades (ECDC) y de la Comisión Europea a través del Programa Incubadora HERA, «Mejora de las infraestructuras y capacidades nacionales de secuenciación del genoma completo (WGS) y/o de la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) para responder a la pandemia de COVID-19», que financia parcialmente la estructura y la puesta en marcha de RELECOV, mejorando la capacidad nacional de secuenciación mediante el uso de herramientas de WGS. En noviembre de 2022, RELECOV participa en la convocatoria EU4H-2022-DGA-MS-IBA-1, lanzada por la Comisión Europea a través de la Agencia Ejecutiva Europea de Salud y Digital (HADEA). Traducción realizada con la versión gratuita del traductor DeepL.com
El proyecto, titulado «Consolidación de las actividades de secuenciación del genoma completo (WGS) y RT-PCR para el SARS-CoV-2 en España con vistas al uso sostenible y la integración de infraestructuras y procesos mejorados en la red RELECOV, RELECOV 2.0», se desarrollará entre julio de 2023 y junio de 2025. Su objetivo es llevar a cabo la vigilancia genómica del SARS-CoV-2, ampliándola a otras infecciones virales respiratorias, para crear sinergias que contribuyan a una respuesta rápida de salud pública ante futuras amenazas sanitarias.

Objetivos

En RELECOV 2.0, el objetivo principal será la identificación de variantes preocupantes (VOC), linajes y sublinajes del SARS-CoV-2 que se encuentran en circulación, así como la identificación de nuevos linajes y sublinajes emergentes. Como objetivo principal del proyecto, se pretende aplicar herramientas de secuenciación del genoma completo (WGS) a la vigilancia genómica del SARS-CoV-2 y ampliar dicha vigilancia a otras infecciones virales respiratorias, como la gripe estacional o el virus respiratorio sincitial (VRS), mediante el establecimiento de una estructura nacional que potencie la experiencia de los miembros de la red RELECOV. Un segundo objetivo del proyecto sería la consolidación de la Plataforma RELECOV, mediante protocolos adecuados para la gestión de datos genómicos, la definición de metodologías conjuntas de secuenciación y análisis, incluidos los controles de calidad, y el desarrollo de herramientas computacionales para la automatización del análisis, la visualización y el intercambio de datos genómicos con bases de datos internacionales.

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